কী জানতে হবে
- কিছু PDB ফাইল প্রোগ্রাম ডাটাবেস ফাইল।
- একটি টেক্সট এডিটর বা Geneious এর মতো একটি প্রোগ্রাম দিয়ে খুলুন।
- আপনার নির্দিষ্ট ডাটাবেস ফাইল খোলে একই প্রোগ্রামের সাথে অন্য ফর্ম্যাটে রূপান্তর করুন।
এই নিবন্ধটি ব্যাখ্যা করে যে একটি PDB ফাইল কী, কীভাবে একটি খুলতে হয় এবং কীভাবে একটিকে ভিন্ন বিন্যাসে রূপান্তর করতে হয়।
পিডিবি ফাইল কি?
PDB ফাইল এক্সটেনশন সহ একটি ফাইল সম্ভবত একটি প্রোগ্রাম ডাটাবেস ফাইল যা একটি প্রোগ্রাম বা মডিউল সম্পর্কে ডিবাগিং তথ্য রাখতে ব্যবহৃত হয়, যেমন একটি DLL বা EXE ফাইল। এগুলিকে কখনও কখনও প্রতীক ফাইল বলা হয়৷
ফাইলটি তার চূড়ান্ত কম্পাইল করা পণ্যে সোর্স কোডের বিভিন্ন উপাদান এবং বিবৃতি ম্যাপ করে, যা ডিবাগার সোর্স ফাইল এবং এক্সিকিউটেবলের অবস্থান খুঁজে পেতে ব্যবহার করতে পারে যেখানে এটি ডিবাগিং প্রক্রিয়া বন্ধ করবে।
কিছু PDB ফাইল এর পরিবর্তে প্রোটিন ডেটা ব্যাঙ্ক ফাইল ফরম্যাটে হতে পারে। এগুলি হল প্লেইন টেক্সট ফাইল যা প্রোটিন স্ট্রাকচার সংক্রান্ত স্থানাঙ্ক সঞ্চয় করে৷
অন্যান্য PDB ফাইলগুলি Palm Database বা PalmDOC ফাইল ফর্ম্যাটে তৈরি করা যেতে পারে এবং PalmOS মোবাইল অপারেটিং সিস্টেমের সাথে ব্যবহার করা যেতে পারে; এই বিন্যাসের কিছু ফাইল পরিবর্তে. PRC ফাইল এক্সটেনশন ব্যবহার করে। এই একই এক্সটেনশন ব্যবহার করে অন্য একটি ফর্ম্যাট হল তানিদা ডেমো বিল্ডার৷
কীভাবে একটি PDB ফাইল খুলবেন
বিভিন্ন প্রোগ্রামগুলি তাদের নিজস্ব PDB ফাইল ব্যবহার করে ডেটা সঞ্চয় করার জন্য কিছু ধরণের স্ট্রাকচার্ড ডাটাবেস ফর্ম্যাটে, তাই প্রতিটি অ্যাপ্লিকেশন তার নিজস্ব প্রকার খুলতে ব্যবহৃত হয়।
Geneious, Quicken, Visual Studio, এবং Pegasus হল কিছু প্রোগ্রামের উদাহরণ যা ফাইলটিকে ডাটাবেস ফাইল হিসেবে ব্যবহার করতে পারে। Radare এবং PDBparseও কাজ করতে পারে।
কিছু PDB ফাইল প্লেইন টেক্সট হিসাবে সংরক্ষিত থাকে, যেমন Geneious' Program Debug Database files, এবং টেক্সট এডিটরে খোলা হলে তা সম্পূর্ণরূপে মানুষের পাঠযোগ্য। আপনি এই ধরনের PDB ফাইলটি যেকোন প্রোগ্রামের সাথে খুলতে পারেন যা টেক্সট ডকুমেন্ট পড়তে পারে, যেমন উইন্ডোজের অন্তর্নির্মিত নোটপ্যাড প্রোগ্রাম। কিছু অন্যান্য সামঞ্জস্যপূর্ণ দর্শক এবং সম্পাদকদের মধ্যে নোটপ্যাড++ এবং বন্ধনী অন্তর্ভুক্ত রয়েছে।
অন্যান্য PDB ফাইল টেক্সট ডকুমেন্ট নয় এবং শুধুমাত্র তখনই উপযোগী হয় যখন এটির উদ্দেশ্যে করা প্রোগ্রামের সাথে খোলা হয়। উদাহরণস্বরূপ, যদি আপনার কোন উপায়ে Quicken এর সাথে সম্পর্কিত হয়, তাহলে এটি দেখতে বা সম্পাদনা করতে সেই সফ্টওয়্যারটি ব্যবহার করার চেষ্টা করুন। ভিজ্যুয়াল স্টুডিও DLL বা EXE ফাইলের মতো একই ফোল্ডারে একটি PDB ফাইল দেখতে চায়৷
আপনি Avogadro-এর মাধ্যমে Windows, Linux, এবং macOS-এ প্রোটিন ডেটা ব্যাঙ্ক ফাইল দেখতে ও সম্পাদনা করতে পারেন। এই প্রোগ্রামগুলি ফাইলটিও খুলতে পারে: Jmol, RasMol, QuickPDB, এবং USCF Chimera। যেহেতু এগুলো প্লেইন টেক্সট, তাই আপনি একটি টেক্সট এডিটরেও খুলতে পারেন।
Palm Desktop এই ফাইলটি খুলতে সক্ষম হবে যদি এটি Palm Database ফাইল ফরম্যাটে থাকে, তবে আপনাকে প্রথমে এটির নাম পরিবর্তন করতে হতে পারে যাতে সেই প্রোগ্রামটির PRC ফাইল এক্সটেনশন থাকে যাতে এটি সনাক্ত করা যায়। ক্যালিবার আরেকটি বিকল্প।
একটি PalmDOC PDB ফাইল খুলতে, STDU ভিউয়ার ব্যবহার করে দেখুন।
Tanida ডেমো বিল্ডার সেই ফর্ম্যাটে ফাইল খোলে।
কীভাবে একটি PDB ফাইল রূপান্তর করবেন
প্রোগ্রাম ডাটাবেস ফাইলগুলি সম্ভবত একটি ভিন্ন ফাইল ফর্ম্যাটে রূপান্তরিত করা যাবে না, অন্তত একটি নিয়মিত ফাইল রূপান্তরকারী সরঞ্জামের সাথে নয়। পরিবর্তে, যদি এমন কোনো অ্যাপ্লিকেশন থাকে যা এই ধরনের ফাইল রূপান্তর করতে পারে, তবে এটি একই প্রোগ্রাম যা এটি খুলতে পারে৷
উদাহরণস্বরূপ, আপনি যদি কুইকেন থেকে আপনার ডাটাবেস ফাইল রূপান্তর করতে চান তবে এটি করার জন্য সেই প্রোগ্রামটি ব্যবহার করার চেষ্টা করুন। এই ধরনের রূপান্তর, যাইহোক, সম্ভবত শুধুমাত্র সামান্য ব্যবহারই নয় কিন্তু এই ডাটাবেস অ্যাপ্লিকেশনগুলিতেও সমর্থিত নয় (অর্থাৎ, আপনাকে সম্ভবত এই ধরনের PDB ফাইলকে অন্য কোনও ফর্ম্যাটে রূপান্তর করতে হবে না)।
প্রোটিন ডেটা ব্যাঙ্ক ফাইলগুলিকে মেশল্যাবের মাধ্যমে অন্য ফরম্যাটে রূপান্তর করা যেতে পারে। এটি করার জন্য, আপনাকে প্রথমে এটিকে ফাইল > > > VRML হিসাবে PyMOL দিয়ে WRL এ রূপান্তর করতে হতে পারে মেনু, এবং তারপরে মেশল্যাবে WRL ফাইল আমদানি করুন এবং শেষ পর্যন্ত PDB ফাইলটিকে রূপান্তর করতে ফাইল > এক্সপোর্ট মেশ অ্যাস মেনু ব্যবহার করুন STL বা অন্য ফাইল ফরম্যাট।
যদি আপনার মডেলটি রঙিন হওয়ার প্রয়োজন না হয়, আপনি ফাইলটি সরাসরি USCF Chimera-এর সাথে STL-এ রপ্তানি করতে পারেন (উপরে ডাউনলোড লিঙ্কটি রয়েছে)। অন্যথায়, আপনি উপরের মত একই পদ্ধতি ব্যবহার করতে পারেন (মেশল্যাবের সাথে) ইউএসসিএফ চিমেরার সাথে পিডিবিকে WRL এ রূপান্তর করতে এবং তারপরে মেশল্যাবের সাথে STL-এ WRL রপ্তানি করতে পারেন।
PDB কে PDF বা EPUB তে রূপান্তর করতে, আপনার যদি একটি PalmDOC ফাইল থাকে, তবে এটি অনেক উপায়ে সম্ভব, তবে সবচেয়ে সহজ হল Zamzar-এর মতো একটি অনলাইন কনভার্টার ব্যবহার করা। আপনি আপনার ফাইলটিকে সেই ওয়েবসাইটটিতে আপলোড করতে পারেন যাতে এটিকে সেই ফর্ম্যাটে রূপান্তর করার বিকল্প থাকে সেইসাথে AZW3, FB2, MOBI, PML, PRC, TXT, এবং অন্যান্য ইবুক ফাইল ফর্ম্যাটে৷
একটিকে FASTA ফর্ম্যাটে রূপান্তর করতে মেইলার ল্যাবের অনলাইন PDB থেকে FASTA কনভার্টার দিয়ে করা যেতে পারে।
PDBx/mmCIF ব্যবহার করে এই ফাইলটি CIF (ক্রিস্টালোগ্রাফিক ইনফরমেশন ফরম্যাট) অনলাইনে সংরক্ষণ করাও সম্ভব।
এখনও খুলতে পারছেন না?
যে ফাইলগুলি উপরে থেকে কোন টুল দিয়ে খুলছে না, সম্ভবত সেগুলি আসলে PDB ফাইল নয়৷ কি ঘটতে পারে আপনি ফাইল এক্সটেনশন ভুল রিডিং করছি; কিছু বিন্যাস একটি প্রত্যয় ব্যবহার করে যা ঘনিষ্ঠভাবে PDB এর সাথে সাদৃশ্যপূর্ণ, যখন তারা সত্যিই সম্পর্কহীন হয় এবং একই কাজ করে না।
উদাহরণস্বরূপ, একটি পিডিএফ ফাইল একটি নথি ফাইল, কিন্তু উপরের প্রোগ্রামগুলির বেশিরভাগই পাঠ্য এবং/অথবা ছবিগুলিকে সঠিকভাবে রেন্ডার করবে না যদি আপনি এই সফ্টওয়্যার প্রোগ্রামগুলির সাথে একটি খোলার চেষ্টা করেন। DBF, DB, ADP, PD, PDE, PDC, PDO, এবং WPD ফাইলের মতো একই ধরনের বানান ফাইল এক্সটেনশন সহ অন্যান্য ফাইলের ক্ষেত্রেও এটি সত্য।
PBD হল আরেকটি যেটি EaseUS Todo ব্যাকআপ প্রোগ্রামের অন্তর্গত এবং তাই শুধুমাত্র সেই সফ্টওয়্যার দিয়ে খোলা হলেই উপযোগী৷
আপনার যদি একটি PDB ফাইল না থাকে, তাহলে আপনার ফাইলে থাকা ফাইল এক্সটেনশনটি নিয়ে গবেষণা করুন যাতে আপনি উপযুক্ত প্রোগ্রামটি খুঁজে পেতে পারেন যা এটি খুলবে বা রূপান্তর করবে।
PDB ফাইলে অ্যাডভান্সড রিডিং
আপনি GitHub এবং Wintellect থেকে প্রোগ্রাম ডাটাবেস ফাইল সম্পর্কে আরও অনেক কিছু পড়তে পারেন।
প্রোটিন ডেটা ব্যাঙ্ক ফাইলগুলি সম্পর্কে আরও জানার আছে; বিশ্বব্যাপী প্রোটিন ডেটা ব্যাঙ্ক এবং RCSB PDB দেখুন৷
প্রায়শই জিজ্ঞাসিত প্রশ্ন
- ভিজ্যুয়াল স্টুডিও PDB ফাইলগুলি খুঁজে পেতে বা খুলতে অক্ষম হলে আমি কীভাবে এটি ঠিক করব? আপনি যদি এমন একটি বার্তা দেখতে পান যে ভিজ্যুয়াল স্টুডিও PDB ফাইল খুঁজে পেতে বা খুলতে পারে না, চেষ্টা করুন ভিজ্যুয়াল স্টুডিওর ডিবাগিং টুল ব্যবহার করে। Tools > Options > Debugging > সিম্বলএ যান এবং Microsoft সিম্বল সার্ভার নির্বাচন করুন
- আমি কিভাবে Android এ একটি PDB ফাইল খুলব? Android এ একটি PDB ফাইল খুলতে, একটি তৃতীয় পক্ষের ফাইল রিডার ব্যবহার করুন৷ Google Play তে Cool Reader অ্যাপ বা অন্য কোনো PDB ফাইল-সমর্থিত রিডার ডাউনলোড করুন।
